康熙通过文、武两种比试，在全国范围内筛选了一批高素质的精英士兵、武将和文职人员，按照他们所擅长的区域，将他们充实到这三个部门当中。
另外对数目庞大，但是不承担主要作战任务的绿营。经过筛选后康熙也做出了调整，他们现在负责在城市或特定地区实施巡查警戒，处置突发事件，骚乱及暴乱事件。遇有严重灾害时，参加抢险救灾和为一线部队输送兵员等任务。
并且规定所有军队的将领全部三年一轮换。
这期间，康熙多方征求意见，参照了古往今来的军队制度，又向南怀仁等传教士详细询问了西方的军制，另外淑云也很隐晦的，在不经意间提出了一些极为有用的建议，才有今天这样的结果。
三方互相协调，又相对独立，最终的权利控制在了皇帝手中，这样一来就在最大程度上预防了叛乱发生的可能。
为了防止出现“兵不识将，将不知兵”的局面，康熙又组织人手为各个兵种分别制定了详细的训练大纲，并规定要严格按照上面的方法和步骤执行。而且康熙还要求各区域内部每年比拼一次，全国三年大比拼一次。优秀的团体和个人，都会得到提升和奖励。也就是说，从今以后士兵和武官擢升的途径已经不再局限于军功了。
这么一连串巨大的变动，给朝堂上带来的影响无疑也是十分巨大的。而每一次新制度的出台无可厚非的都会惹来争议，当然这次也不会例外。有赞同的，自然也有反对的。
而牵扯到个人利益，几乎所有的武官对这一系列的政策都持支持的态度。武官的利益扩大了，在文官看来，他们的利益就必定要受到损害。这些人自然也就不愿意了，而且自宋朝绍兴党禁开始，中国官场上的文官和武将就成了两个敌对的势力，他们互相拆台，互相倾轧，除了开国之初打天下的一段时间，就很少再有合作了。这不得不说是中国的一种悲哀。
当然也就没有哪个文官愿意看到武将做大，文官们气得要死。没想到一个谋反事件居然惹出这么多的事来。而且那是索额图那帮人的错，又不关他们的事，他们可是老实、听话的很，凭啥有了好处只给那些粗鲁的丘八们啊？
几个年老的翰林为此都气病了。因此朝堂上反对的声音很大，甚至出现了冒死劝谏的把戏。
但是事关军队改革，康熙容不得别人置喙。以他现在的强势和权威，这些人跟本就阻止不了康熙的决定，而且康熙如今已经把舆论宣传运用的炉火纯青，他在第一时间就利用报纸占据了舆论的主导地位。经过了一些必要的妥协，又狠狠的整治了几个带头反对的。这些政策还是被康熙按照他全部的意志颁布了下去，并且在一众武官的努力下，顺利的得到了执行。
可即便如此，康熙还不满足，他又在军队中单独发行了一份报纸，专门用来宣传忠君思想。为了解决大多数士兵不识字的问题，康熙又责令各部队的将领专门组织人手每天给战士们读报纸。
等康熙把所有的工作全部理顺，各部队走上正轨的时候，已经过去了半年多，时间进入到了康熙三十年（公元1691年）四月初。
康熙这个不甘寂寞的家伙还没休息上几天呢，又突然决定要巡抚蒙古了。
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